Тектоническая структура Среднесибирского плоскогорья приурочена к Сибирской платформе с двумя щитами: Анабарским на севере и Алданским на юго-востоке. Рельеф плоскогорья состоит из широких плато и кряжей, в тоже время есть долины с отвесными склонами. Средняя высота перепада в рельефе составляет 500-700 метров, но встречаются части плоскогорья, где абсолютная отметка поднимается выше 1000 метров, к таким участкам относится Енисейский кряж. К одному из самых высоких участков территории относится плато Путорана, его высота составляет 1678 м над уровнем моря. Таким образом, преобладают горные формы рельефа.