Зачем нужны знаки препинания между генами и почему их нет внутри генов?

Вы имеете в виду стоп-кодоны? их нет в середине гена потому что если они там появятся середина автоматически превращается в конец гена. Их функция - остановка синтеза белка. Есть ещё стартовый кодон который одновременно кодирует аминокислоту метионин и если она не нужна в белке то она потом отщепляется. Он всегда есть в начале и может встречаться в середине гена.