Как вы думаете, почему нельзя построить филогенетические ряды для всех эволюционных ветвей?

 Их нельзя  построить, т..к  эволюция идёт   постоянно,  за многие столетия  какие -то виды в ходе естественного отбора   вымирали, какие-то  оставались, преобразовывались, появлялись новые.  Найти связь очень  трудно,  ещё труднее всё это достоверно проверить.  Чедовечество появилось  сравнительно недавно,  а  живые организмы  развивались и существовали  в далёком Доказательств нет.

Для построения филогенетических рядов нужны доказательства. 
Прежде всего - палеонтологические: остатки, следы,скелеты, захоронения и прочее. 
Затем своё слово берёт сравнительная анатомия, указывая на гомологи и аналоги,рудименты и атавизмы. 
Эмбриология изучает зародышевое сходство. 
Всё это классифицируется систематикой, и если выпадает какое-то звено в доказательствах, филогенез эволюционной ветви не выстраивается.