Расставьте знаки препинания. Объясните расстановку знаков

В Александрии работало немало выдающихся учёных (1) среди (2) которых географ и математик Эратосфен (3) сумевший вычислить диаметр Земли с высокой по тем временам точностью (4) математик Эвклид (5) написавший 13 томов «Начал» геометрии (6) астроном Аристарх Самосский (7) почти за две тысячи лет до Коперника установивший (8) что Земля – шар (9) вращающийся вокруг Солнца.
Уже более недели (1) господин жил в городе (2) разъезжая по вечеринкам (3) и обедам (4) и таким образом проводя (5) как говорится (6) очень приятно время. Наконец он решился перенести свои визиты за город (7) и навестить помещиков Манилова и Собакевича (8) которым дал слово. Может быть (9) к сему побудило его дело более серьёзное.
Когда пароход остановился среди реки (1) тесно загромождённой судами (2) и ощетинившейся сотнями острых мачт (3) к борту его подплыла большая лодка со множеством людей и подцепилась багром к спущенному трапу (4) и уже через минуту один за другим люди (5) из лодки (6) стали подниматься на палубу. Впереди всех быстро шёл сухонький старичок в чёрном длинном одеянии (7) и с рыжей (8) как золото (9) бородкой.
Увидев бравого бородача (1) шагавшего по улице в форменной шинели и фуражке (2) которую носили только офицеры (3) старушка (4) потрясённая известиями о стремительном движении деникинских частей (5) и о том (6) что они вошли в город с бесчисленным количеством вооружения (7) собранного силами (8) поддержавших деникинцев местных отрядов (9) не на шутку перепугалась.
Переминаясь с ноги на ногу (1) и дрожа от холода (2) Дима (3) немного выждав (4) вновь постучал в (5) обитую толстой жестью (6) дверь (7) однако (8) желанного отклика так и не последовало (9) и тогда он направился домой.
Я поднял голову вверх (1) и увидел (2) освещающие горизонт (3) молнии (4) которые отпечатывались на небе (5) оставляя яркие следы (6) и рвали (7) затянувшие всё небо (8) тучи
​

1) В Александрии работало немало выдающихся учёных, среди которых географ и математик Эратосфен. В данной фразе используется запятая для выделения пояснительной информации, указывающей на конкретных учёных, работавших в Александрии.
2) математик Эвклид, написавший 13 томов "Начал" геометрии. Здесь запятая разделяет две различные информации о математике Эвклиде: его профессию и его достижение в написании 13 томов "Начал" геометрии.
3) астроном Аристарх Самосский, почти за две тысячи лет до Коперника установивший, что Земля – шар, вращающийся вокруг Солнца. В данной конструкции запятая отделяет пояснение, сказуемое или определение от других слов или предложений, которые стоят на границе оговоренного выше.
4) Уже более недели господин жил в городе, разъезжая по вечеринкам и обедам. Запятая включает прямую речь, образуя однородное подлежащее. Здесь запятая устанавливается между однородными членами, чтобы дать им равную роль в предложении.
5) таким образом проводя, как говорится, очень приятно время. Здесь запятая используется для выделения вводных слов или фраз. В данном случае, фраза "как говорится" добавляется смысловую информацию, но не является необходимой для основного предложения.
6) Наконец он решился перенести свои визиты за город и навестить помещиков Манилова и Собакевича, которым дал слово. В этом предложении используется запятая для выделения придаточного предложения отношения, которое является поясняющим дополнением к основному предложению.
7) Может быть, к сему побудило его дело более серьёзное. Запятая используется для выделения вводных слов и фраз, которые могут быть опущены или переставлены в предложении без изменения его смысла.
8) Когда пароход остановился среди реки, тесно загромождённой судами, и ощетинившейся сотнями острых мачт, к борту его подплыла большая лодка со множеством людей и подцепилась багром к спущенному трапу. Запятая используется для обозначения перечисления и представления дополнительной информации о реке.
9) уже через минуту один за другим люди, из лодки, стали подниматься на палубу. Здесь запятая используется для выделения пояснительной информации - откуда поднимаются люди.
10) Впереди всех быстро шёл сухонький старичок в чёрном длинном одеянии и с рыжей, как золото, бородкой. Запятая используется для выделения описания старика, представляющего собой отдельное по смыслу выражение.
11) Увидев бравого бородача, шагавшего по улице в форменной шинели и фуражке, которую носили только офицеры, старушка, потрясённая известиями о стремительном движении деникинских частей и о том, что они вошли в город с бесчисленным количеством вооружения, собранного силами, поддержавших деникинцев местных отрядов, не на шутку перепугалась. В этом предложении запятая используется для разделения нескольких пояснений и дополнения за одну запятую для большей ясности и отделения.
12) Переминаясь с ноги на ногу и дрожа от холода, Дима, немного выждав, вновь постучал в обитую толстой жестью дверь, однако, желанного отклика так и не последовало и тогда он направился домой. Запятая в данной фразе используется для выделения по рядка и представления дополнительной информации о Диме.
13) Я поднял голову вверх и увидел освещающие горизонт молнии, которые отпечатывались на небе, оставляя яркие следы и рвали затянувшие всё небо тучи. Эта конструкция не требует использования запятых, так как нет необходимости выявлять отдельные конструкции или добавлять пояснения к предложению.