Подчеркнуть навстречу ветру и в течение нескольких секунд

оба выражения подчеркиваешь пунктиром (точка-тире), потому что оба они обстоятельства
бежал (куда?) навстречу ветру - обстоятельство места (нельзя спрашивать навстречу (чему?)
происходило (когда?) в течение нескольких секунд - обстоятельство времени - нельзя спрашивать в течение (чего?)
(при разборе предложения по членам предложения к таким выражениям падежные вопросы не ставятся)