Почему в слове бракованный пишется нн?

Потому что это вовсе  не прилагательное, а причастие времени в сртадательном залоге от глагола браковать. пишется оно с двумя НН потому, что есть правила написания таких причастий в котором сказано, что слова, оканчивающиеся на -ованный и  еванный, кроме кованый, пишутся с двумя НН.
Надеюсь, объяснила)

Возможно образовалось от слова Бракован (наречие) при суффикса