Объясните, какое из ниже имён существительных уместно использовать в научной статье, а какое нет. свой ответ аргументируйте. апельсинище, составчик,атмосфера,собачка.

Уместно использовать слово атмосфера, т.к. другие слова имеют уменьшительно- ласкательные суффиксы, которые не используются в научном стиле. Для научного стиля характерны строгость и конкретика. 

Атмосфера, т.к. это природное явление, ну и термин всё таки.
Атмосфера — газовая оболочка небесного тела, удерживаемая около него гравитацией.