Как правильно пишется? отметить в заключение или отметить в заключении ?

В заключениЕ - это производный предлог, образованный от существительного, пишется на конце с буквой Е. Его значение: " под конец, в конце, заканчивая".
  Например: В заключение беседы учитель предложил задавать вопросы.
Существительное ЗАКЛЮЧЕНИЕ в предложном падеже имеет окончание И. Значение:  1) "место, в котором держат лишенный свободы", 2) "вывод, следствие чего-то".
  Например: В заключении своей работы автор подвел итоги исследования.

В вопросе задания наблюдается двусмысленность,
можно написать: 1)В заключение своего выступления (когда?) докладчик отметил необходимость продолжить исследование по данной теме. ( т.е. в конце выступления). Здесь  В ЗАКЛЮЧЕНИЕ - предлог.
2) В заключении врач отметил, что пациент требует дополнительного обследования ( в выводах).  Здесь В ЗАКЛЮЧЕНИИ (в чём?) существительное с предлогом В.