Как правильно: 1. с вашего позволения я не приду. 2. с вашего позволения, я не приду.

Выражение "с Вашего позволения" может являться в предложении вводным словосочетанием, а может быть просто частью предложения. В зависимости от этого и можно ответить на вопрос, обособляется это выражение запятыми или нет.
Если это вводное выражение, то есть выражение которое употребляется в виде вежливой формы обращения, тогда оно выделяется запятыми. Я, с Вашего позволения, хотел бы прогуляться.
Если это выражение просто часть предложения, тогда запятые не ставятся. Она приходит сюда только с Вашего позволения.