Как фонетика связана с орфографией?

фонетика изучает звуки в слове

орфография изучает знаки препинания в предложениях

они не связаны

Фонетика-звуки.орфография-правильность написания(запятые и т.д) они никак не могут быть связаны,разве,что на мягких согласных ставится ‘. Например «лист» [л’]