Грамматическую основу "само собой, том отдёрнул палец, жук полетел в проход между скамейками и шлёпнулся на спину, а палец том засунул в рот."

В этом предложении несколько грам.основ, так как предложение сложное.
Том отдёрнул;
жук полетел, шлепнулся;
Том засунул.
Три грам.основы. Это сложное предложение с разными видами связи: бессоюзной и союзной сочинительной.