Гастродия высокая — травянистый многолетник. Его прямые толстые стебли могут достигать 1 м в высоту. Они не имеют листьев. Зацветает гастродия японская в июле—сентябре. На ней появляются цветы, собранные в кисть длиной около 15—20 см. Губа, отличительная черта всех орхидных, у гастродии кремовато-белая. В августе—октябре на гастродии образуются плоды — небольшие коробочки, в которых вызревают мелкие бурые семена.