Разница между атомной молекулой и химическим элементом

Двух(трех)атомные молекулы это простые вещества
Химический элемент — это атомы одного и того же вида. То есть атомы водорода - это элемент водорода. Химический элемент это, как бы, буковка в таблице

Различить простое вещество и химический элемент можно так:
Когда говорят про простое вещество, обязательно упоминают про «вхождение в состав чего-то». В остальных случаях имеется ввиду химический элемент.