Атом натрия отличается от иона натрия

натрий имеет валентность 1. Значит у него на внешней орбите атома крутится 1 электрон. Сколько у него протонов и нейтронов для этого вопроса не важно. Важно что у нормального атома количество положительно-заряженных частиц в ядре (протонов) равно количеству отрицательно-заряженных частиц (электронов) на орбитах, поэтому общий заряд атома нейтрален. 
У иона не хватает одного или нескольких электронов (как правило с самой внешней орбиты) и общий заряд атома становится положительным. Применительно к натрию получается, что для того чтобы его атом ионизировался он должен потерять свой единственный электрон с внешней орбиты