Реки Мадагаскара короткие, порожистые и полноводные в течение всего года. Реки, текущие к западному побережью и несущие свои воды в Мозамбикский пролив, как правило, более протяженные и с не таким быстрым течением, как восточные, благодаря более пологому спуску Центрального нагорья в западном направлении. На Мадагаскаре расположены три крупных озера: Алаутра (900 км), Ихутри (112 км) и Кинкуни (100 км)