Коньюгация хромосом происходит в фазу профазы-I на стадии зигонемы. На стадии зигонемы (зиготены) попарно сближаются гомологичные хромосомы (одинаковые по форме, величине). Хромосомы притягиваются и прикладываются друг к другу по всей длине, т. е. коньюгируют в области хромомеров. Это похоже на замок «молния». Пару гомологичных хромосом называют биваленты (тетрады). Нарушение коньюгации приводит к тому, что не происходит кроссинговер – обмен гомологичными участками хроматид (стадия пахинемы). В метафазу на экваторе клетки гомологичные клетки выстраиваются в ряд. В отсутствии коньюгации будет нарушена перекомбинация генетического материала, что приведёт к образованию менее разнообразного потомства по генотипу и фенотипу. При отсутствии бивалентов будет отсутствовать независимое расхождение гомологичных хромосом, что приводит к нарушению различных комбинаций отцовских и материнских хромосом.