При тепловом движении атомы совершают беспорядочные колебания относительно положений равновесия, но не перемещаются относительно друг друга:

Сосуды древесины - это ксилема. По ней вверх от корней передвигается вода и минеральные соли. Если мы возьмем воду и подкрасим ее акварельной краской (она будет выполнять роль минеральных веществ), поставим в банку с подкрашенной водой живую ветку, то спустя сутки разрезав ветку мы увидим, что древесина ветки окрашена. это по сосудом подкрашенная вода и окрасила их. окраску видно и на поперечном срезе и на продольном.