Появление Сибирского приказа означало, что государство заинтересовано в развитие этих земель. В некоторых делах его функции пересекались с полномочиями других приказов. В Сибири основывались новые остроги, часть из них – на границах. А пограничные укрепления находились в ведении Разрядного приказа. В необъятной тайге нередко скрывались преступники – их поимка была делом Разбойного приказа.