Наиболее важные изменения происходят в зоне дифференциации. Многие наружные клетки корня образуют выросты, дающие начало корневым волоскам. В центральном цилиндре из клеток, расположенных в центре корня, образуются ситовидные трубки и сосуды. У клеток внутреннего слоя коры происходят изменения в строении оболочек, обеспечивающие избирательное проведение растворов минеральных веществ. Защитную функцию принимают на себя наружные слои клеток коры. В дальнейшем у некоторых растений образуется пробка.