Процесс гаструляции происходит путём втягивания внутрь участка стенки бластулы. При этом клетки зародыша продолжают очень быстро делиться. Гаструла состоит из двух слоёв — наружного (эктодермы) и внутреннего (энтодермы). Затем между ними у большинства многоклеточных животных (за исключением губок и кишечнополостных) развивается третий, промежуточный зародышевый слой — мезодерма.