Кожа и у птиц, и у пресмыкающихся сухая и тонкая и лишена желез. У рептилий кожа покрыта чешуями и щитками, у птиц – перьями, видоизменёнными чешуями. Также как и у пресмыкающихся, у многих видов птиц наблюдается сезонная линька: к зиме количество пуха увеличивается, к лету — уменьшается. Еще одно сходство – наличие когтей и грубой кожи с роговыми чешуями на нижней части ног у птиц. Также очень похожи по внешнему виду зародыши птиц и пресмыкающихся.