Почему среди примитивных организмов встречаются и такие, которые трудно отнести к определенному царству

Наверное, речь о вирусах. Их нельзя назвать неживыми, поскольку они размножаются, имеют генетический материал и эволюционируют. Однако считается, что элементарная единица живого - клетка. А вирусы не имеют клеточного строения. По сути, вирус - это хорошо упакованный генетический материал, который к размножению только внутри клетки хозяина. 

Можно еще про хламидий что-нибудь написать. Они тоже вне клетки хозяина ничего не умеют. Но им больше повезло, чем вирусам. Их считают живыми.

Если немного с другой стороны подойти, можно взять какую-нибудь Эвглену зеленую. С одной стороны, животное - умеет плавать и кушать. С другой стороны, если света хватает - отлично фотосинтезирует, то есть получает питательные вещества по типу растения. Вот и думай куда ее определить.