Пептиды и аминокислоты-это одно и то же?

Нет. Аминокислоты это мономеры пептидов и белков. Это отдельное вещество, которое в последующих этапах будет в ряду с другими аминокислотами, образуя петидную цепочку.

Белок может состоять из нескольких цепочек пептидов, образуя глобулу.

Аминокислота->Пептид->Пептидные цепочки->Белок.