Из-за быстрого размножения цианобактерий вода в водоеме начинает цвести. Некоторые виды водорослей (а цианобактерии можно таковыми назвать из-за наличия полного фотосинтетического аппарата) выделяют нейротоксины, которые в больших количествах являются ядом и нанести большой ущерб окружающей среде
На озере Улюколь в Дзержинском районе из-за нехватки кислорода массово погибла рыба.