Основным доказательством является то, что в процессе своего эмбрионального развития зародыш млекопитающих на одной из стадии напоминает своим видом и строением зародыш пресмыкающихся это филогенетическое доказательство. Кроме того, у млекопитающих и пресмыкающихся наблюдается сходство кожных покровов волосяной покров млекопитающих и роговые чешуи пресмыкающихся имеют одинаковое происхождение. И естественно наиболее примитивные млекопитающие такие как утконос и ехидна показывают яркое сходство в том, что так же как и пресмыкающиеся являются яйцекладущими.