Когда его успехи в школе пошли на убыль, Шуберт отказался от возможности продолжать образование и вернулся домой в октябре 1813 года. После посещения института учителей он начал работать в качестве ассистента своего отца, продолжая занятия с Антонио Сальери до 1816 года.
В учёбе Шуберту тяжело давались математика и латынь, и в 1813 году его отчислили из хора, так как ломался голос. Шуберт вернулся домой и поступил в учительскую семинарию, которую окончил в 1814 году. Затем устроился преподавателем в школу, где работал его отец. (в этой школе он работал до 1818 года). В свободное от работы время он сочинял музыку. Изучал преимущественно Глюка, Моцарта и Бетховена. Первые самостоятельные произведения — оперу «Увеселительный замок сатаны» и мессу фа мажор — он написал в 1814 году.