Расставьте заптые в этом городе помимо людей и домов живут животные

В этом городе, помимо людей и домов, живут животные.

Выделяется, потому что помимо = кроме.

PS: у Вас в предложении речевая ошибка! Вы людей и домов объединили словом живут. Дома жить в городе не могут, они могут стоять!)) 

Предлагаю такой вариант: В этом городе, помимо людей, живут животные и стоят дома.