Примеры колебания одушевленности/неодушевленности имен существительных. каковы причины этих колебаний?

Эта категория не связана с биологической - "живой-неживой". Например, НА ДОРОГЕ ЛЕЖИТ ДОХЛАЯ СОБАКА. Собака неживая, но СЛОВО отвечает на вопрос "кто" - это одуш. сущ. Или кто? -мертвец, что? -труп (синонимы, но категория разная) . Еще слова, которые обозначают всякие "съедобности" (типа приготовить ЧТО? -кальмары, креветки, но вижу в море КОГО? -креветок, кальмаров) ; также колебания наблюдаются в словах типа БАКТЕРИЯ, МИКРОБ...