Получив команду с берега остановиться, теплоход прекратил движение, но в результате этого простоя нарушался график прибытия в порт, где уже ждали встречающие. нельзя допускать простоев в работе!

В первом где отмечено "простоя" -в прямом смысле , т.к. простой здесь как ненужная остановка, а во втором случае переносное значение. Имеется ввиду обобщенное мнение о ленивых людях которые не выполняют свою работу так, как ее нужно выполнять.