Во почему все называют чечевицына по фамилии не упоминая его имени

Это неудивительно, так как в то время все интеллигентные люди обращались друг к другу на "Вы", даже дочка говорила свой маменьке "Вы", это можно проследить во многих творениях других авторов, например, у Достоевского, а не только у Чехова

А при таком обращении можно называть только фамилию, а имя во вторую очередь.

Потому что Чехов показывает мальчика со взрослым характером. Автор считает, что человеку с таким взрослым характером имя не требуется.