Почему коменданта и петра гринёва потащили на площадь к пугачеву?

Они и Иван Игнатьевич единственные пытались противостоять Пугачёву, и выступив против "государя" должны были быть казнены, если не присягнут ему.

Потому что Петр, как и все другие защитники крепости, (все кроме предателя Швабрина) отказывались присягать самозванцу (Пугачеву), поэтому всех не присягнувших отводили на площадь за тем чтобы повесить.