Во время дефрагментации происходит переписывание файлов на жёстком диске, система переносит одни файлы в начало диска, а другие в конец, а так как сейчас жёсткие диски имеют объём 1-2-3-4 и т.д. терабайт, то дефрагментация (группирование, перенос, файлов) занимает много времени.