На неё возлагались особые задачи, для чего были постепенно образованы шесть отделений канцелярии, имевших самостоятельное положение, а по своему значению равные министерствам. I отделение занималось подготовкой высочайших указов, приказов и рескриптов, контролем за их исполнением, представлением государю докладов и прошений. II отделение имело своей целью не сочинение новых законов, а приведение в порядок действующих. Именно через него действовал М.М. Сперанский. III отделение занималось сыском и следствием по политическим делам, осуществляло цензуру, боролось со старообрядчеством и сектантством, ведало политическими тюрьмами, расследовало дела о жестоком обращении помещиков с крестьянами, позднее надзирало за революционерами и антиправительственно настроенными общественными деятелями. IV отделение занималось делами благотворительности: женским образованием, приютами, здравоохранением. V отделение было создано в 1835 году для подготовки реформы государственной деревни и управления государственными крестьянами Петербургской губернии. Во главе этого отделения был поставлен граф П.Д. Киселёв. В 1837 преобразовано в Министерство государственных имуществ Российской империи. VI отделение учреждено в 1842 году временно. Занималось устроением мирной жизни в Закавказском крае.