Внутренние факторы — компонент ПТК и связи между ними. Большое компонентов и связей обеспечивает большую устойчивость комплекса, т. е. он более постоянен и менее подвержен влиянию извне, имеет большую способность к восстановлению. Изменение внутренних факторов ведёт к эволюции ПТК в направлении повышения устойчивости. Примеры: зарастание озёр, смена березняков ельниками, заболачивание леса и другое.