По способу получения энергии бактерии подразделяют на гетеротрофных, питающихся готовыми органическими веществами и автотрофных, способных самостоятельно синтезировать органические вещества из неорганических путем фотосинтеза или хемосинтеза. Так, например, готовыми органическими веществами питаются гнилостные, патогенные и многие другие бактерии. Способностью к фотосинтезу обладают цианобактерии, к хемосинтезу — серобактерии и др.
Для получения энергии бактерии используют различные органические и неорганические соединения и солнечный свет. Большинство бактерий гетеротрофы – т. е. питаются готовыми органическими веществами (гниющими остатками организмов или паразитируют на других организмах). Автотрофных бактерий не много. Часть из них способна к хемосинтезу – синтезу органических веществ из неорганических за счет энергии окисления неорганических соединений. Некоторые бактерии способны к фотосинтезу