Можно ли считать, что положительные эмоции — «хорошие», а отрицательные — «плохие»?

Однозначно сказать нельзя. Например, человек кого-то испугался. Это плохо. Но в то же время испуганный человек вовремя спрятался от опасности, таким образом, спас свою жизнь. Это хороню.