В 1558 году началась Ливонская война. В 1559 было заключено короткое перемирие, после которого битва возобновилась, а в 1560 году русскими войсками был взят город Мариенбург, а затем и ливонская крепость Вильянди. Поскольку в ходе сражений русским удалось совершить разгром самых сильных частей Ливонского ордена, а его магистра Фюрстенберга взять в плен, существование Ливонского ордена, как самостоятельного военного войска, прекратилось. Благодаря эстонским и латышским крестьянам, русским войскам было значительно проще осуществлять военные действия в Прибалтике. Прибалтийскими крестьянами Ливонская война рассматривалась как борьба за изгнание немецких феодалов и возможность последующего присоединения к Русскому государству