Некоторые виды синантропных животных, особенно крысы и мыши, наносят большой экономический ущерб. Они не только поедают и портят продовольственные продукты, прогрызают полы и стены зданий, но могут стать причиной пожаров, повреждая изоляцию электропроводов. Многие из теплокровных синантропов являются хозяевами паразитов. При этом очаги многих инфекций могут существовать и поддерживаться с помощью синантропов даже в жилье человека. Человек ведет непрерывную борьбу с синантропными животными, приносящими ему вред.