Ствол включает продолговатый, задний, средний и промежуточный мозг, а также ретикулярную формацию. Здесь расположены ядра, от которых отходят 12 пар черепных нервов. Они иннервируют органы чувств, ткани головы, шеи, органы грудной и брюшной полостей.