Байкальская котловина располагается в зоне краевого шва древней платформы. Как следствие, западный борт котловины преимущественно сложен архейскими и архей-протерозойскими комплексами пород фундамента и осадочного чехла древней платформы, тогда как восточный борт сложен породами фанерозойского возраста. Образование котловины связано с рифтовыми разломами. Котловина Байкала представляет собой грабен.