Противоречат ли два закона друг другу закон мендаля закону моргана и почему?

Ничуть не противоречат. Просто Мендель (у него, кстати. ТРИ закона) рассматривал наследование несцепленных признаков (это его третий закон, закон независимого наследования), а Морган (с позиций хромосомной теории) изучал наследование сцепленных признаков. Вот и всё!