Почему большая часть живых организмов является аэробами?

Аэробы - те, кто дышат кислородом в атмосфере или растворимым в воде.
Аэробное дыхание характерено и для животных, и для растений. Благодаря кислороду, происходит третий этап энергетического обмена, благодаря которому выделяется огромное кол-во энергии и не менее огромное кол-во тепла ( для согревания самого организма), происходит фотосинтез и прочее. Поэтому с момента появления кислорода на Земле "выросли" потребители и производители его, т.е аэробы. 
Для сравнения и понятия анаэробы (которые не потребляют кислород) - это в частности паразиты, например, проживающие в кишечнике ЧЕЛОВЕКА ( а он аэроб).