What time ... your brother usually ... up? 1 will, be waking
2 do, wake
3 are, waking
4 does, wake

4. does, wake

Объяснение:

Если перевести, то можно увидеть, что действие (wake up) регулярно повторяется (наводящее слово: usually), следовательно, нужно использовать Present Simple. (от сюда: are, will не подходят)

Речь идёт о 3 лице (brother), следовательно к do добавляется -es.